[spk]

Из админ-панели перестали сохраняться некоторые настройки.
Например не сохраняются настройки производительности.
Или не изменяются настройки email в модули "интернет-магазин".

А вот настройки доменов в модуле "конфигурация" работают.

С чем такое может быть связано?

[spk]

Может права на какие-то директории выставлены неправильные?

[admin]

Я бы скорее предположил, что:
Версия 1: настройки изменяются везде, но эти изменения не везде отображаются (проверьте кэш в самой UMI и кэширующие механизмы хостинга)
Версия 2: не все настройки меняются, но это больше похоже на баг, чем на особенность распределения прав в UMI.CMS (тут уже если только смотреть лично)